اسـتفاده از Real time PCR کمـی، در بسـیاری از آزمایشگاه‌های تشخیصی و مولکولی در حال افزایش بوده در واقـع جایگزین خوبی برای PCR معمولی اسـت. مزیت اصلی qPCR نسـبت بـه  PCR معمولی آن است که غلظت DNA اولیه با دقت و حساسیت بالایی تعیـین مـی‌گـردد. بـدین ترتیـب نتـایج به دست آمده میتواند به‌صورت کیفی یـا کمـی باشـد. سـازگاری و مزیـت فـناوری Real time PCR در مطالعـــه‌هـــای متعـــدد از قبیـــل زیســـت پزشـــکی، میکـروب‌شناسـی، دامپزشـکی، کشـاورزی، داروشناسـی، بیوتکنولوژی و سم‌شناسی تأیید شده است. همچنین ایـن فناوری کاربردهای جالب و جدید دیگری از جمله تعیین کمیت و تعیین ژنوتیپ عوامل عفونی، بررسی بیان ژن‌ها، آنالیز DNA متیله شده و میکرو RNA، تأییـد داده‌هـای میکرواری، افتراق آللی و ژنوتایپینگ دارد.